Kronik. Den Google-finansierede forskningsgruppe DeepMind har skabt en algoritme, der kan forudsige proteinstrukturer med hidtil uset præcision. Desværre har de ikke delt deres beregninger, metoder eller software med omverdenen.
VM i molekylære puslespil
År 2020 blev puslespillets år – også i nørdernes verden. Ved Critical Assessment of protein Structure Prediction (CASP)-konkurrencen kæmper forskere hvert andet år mod hinanden om at løse nogle af naturens mest komplicerede puslespil – proteinstrukturer. I december lykkedes det den Google-finansierede forskningsgruppe DeepMind at slå konkurrenterne med flere længder. Med deres avancerede algoritme AlphaFold2 kunne DeepMind i visse tilfælde forudsige proteinstrukturer lige så præcist, som de kan måles i laboratoriet. Hvorfor AlphaFold2 kan blive et vendepunkt i både grundforskning og sygdomsforståelse, vender vi tilbage til – for at forstå omfanget af nyheden må vi først dykke ned i proteinernes verden.
Proteiner er essentielle og komplekse molekyler med forskelligt formede fordybninger og snirklede fangarme. De står for størstedelen af livets molekylære processer og er kernen i alt fra energiomsætning til signalering i nervesystemet.
Del: